子供はいませんでした・・・
モーツァルトは妻・コンスタンツェとの間に4男2女をもうけたが、そのうち成人したのはカール・トーマスとフランツ・クサーヴァーだけで、残りの4人は乳幼児のうちに死亡している。
フランツは職業音楽家となり、「モーツァルト2世」を名乗った（フランツは弟子のジュースマイヤーの名であり、このためフランツ・クサーヴァーはモーツァルトの実子ではなく、妻・コンスタンツェとジュースマイヤーとの婚外子という説がある）。
成人した2人の男子はどちらも子どもを残さなかったため、モーツァルトの直系の子孫は居ない。